Literárne fondy a zbierky Literárneho archívu obsahujú archívne dokumenty osobností kultúry, vedy a politiky s osobitným zreteľom na osobnosti slovenskej literatúry a literárnej vedy, ako aj dokumenty z činnosti rôznych inštitúcií a spolkov literárneho charakteru. Časť fondov a zbierok je spracovaná analyticky a prístupná bádateľskej verejnosti. Časť predstavujú osobné fondy, fondy inštitúcií a spolkov a zbierka jednotlivín, ktoré sa priebežno dopĺňajú, sú spracované formou dočasných súpisov a prístup k nim je obmedzený.

A/ Analyticky spracované fondy a zbierky:

Údaje uvádzané pri popise fondov: 
Signatúra (sign.) - názov fondu - počet dokumentov (jd.) - počet škatúľ (šk.) - časový rozsah fondu, zbierky - archívne pomôcky (I - inventár, S - súpis, K - katalóg, R - register)

1. Osobné fondy:

A B C Č DĎ EF G H CHI J K L M N O P R S Š T U VW ZŽ

2. Fondy kultúrnych inštitúcií a spolkov:

A B C Č D Ď E F G H CH I J K L M N O P R S Š T U V W ZŽ

Údaje uvádzané pri popise zbierok: 
Názov zbierky - signatúra (sign.) - časový rozsah fondu, zbierky - počet dokumentov (jd.) - archívne pomôcky (I - inventár, S - súpis, K - katalóg, R - register)

3. Zbierky: 

a/ Zbierka korešpondencie  – Sign. A 1 - A 1726; 1621 – 1960, 6 499 jd., I, K, R 
     Zbierka literárnych prác – Sign. B 1 - B 1312; 1532 – 1954, 2 567 jd., I, K, R
     Zbierka náučných a iných prác – Sign. C 1 - C 1537; 1300 – 1964, 9 471 jd., I, K, R

Geneticky najstaršia časť dokumentov Literárneho archívu, ktorá je výsledkom zbierkotvornej činnosti Matice slovenskej od jej vzniku v roku 1863 až do roku 1960.


b/ Zbierka rukopisov historických knižníc na Slovensku 

Zbierka obsahuje rukopisy literárneho, historického a náboženského charakteru z kláštorných knižníc z celého Slovenska. V rokoch 1951 – 1954 po zrušení kláštorov boli zverené popredným slovenským kultúrnym inštitúciám vrátane Matice slovenskej, a tak sa stali súčasťou vtedajšieho Literárneho archívu. Na základe reštitúčných zákonov č. 298/1990, 403/1990, 338/1991 a 282/1993 bola časť dokumentov vrátená pôvodným majiteľom. 
Rukopisy historických knižníc na Slovensku I - Sign. RHKS 1 - RHKS 1220, 1600 – 1950, 1 246 jd., I, K, R
Rukopisy historických knižníc na Slovensku II - Sign. RHKS 1221 - RHKS 2642, 1549 – 1955, 1 452 jd., 
I, K, R
Rukopisy historických knižníc na Slovensku II (dodatky) - Sign. RHKS 2643 - RHKS 2687, 1305 – 1949, 
442 jd., I, K, R
Rukopisy historických knižníc na Slovensku III (Marianka) - Sign. M 1 - M 294, 1480 – 1929, 294 jd., I, K, R
Rukopisy historických knižníc na Slovensku IV (Jasov) - Sign. JAS 1 - JAS 863, 1510 – 1943, 872 jd., I, K, R

c/ Zbierka rukopisov Muzeálnej slovenskej spoločnosti - Sign MSS 1 - MSS 688, 1603 – 1946, 696 jd., I, K, R 
Zbierka obsahuje písomnosti Muzeálnej slovenskej spoločnosti, ktorej knižnica sa v roku 1927 stala súčasťou Bibliotéky Matice slovenskej. Písomné a obrazové dokumenty Bibliotéky boli v roku 1954 presunuté do novovzniknutého Literárneho archívu. 

d/ Zbierka jednotlivín z Archívu Slovenského národného múzea v Martine - Sign. MJ 1 - MJ 1020, 1495 – 1919, 1 668 jd., I, K, R 
Zbierka obsahuje dokumenty literárnokultúrneho charakteru, ktoré pochádzajú z Archívu Slovenského národného múzea. Na základe delimitácie sa v roku 1960 stali súčasťou zbierok vtedajšieho Literárneho archívu.  

e/ Zbierka jednotlivín - Sign. J 1 - J 4936, pol. 11. stor. – 20. stor., 4 936 jd., S, K
Zbierka jednotlivín obsahuje archívne dokumenty najrôznejšieho charakteru zo všetkých vedných disciplín a oblastí života spoločnosti, ktoré navzájom nesúvisia provenienčne, chronologicky ani obsahovo.  

f/ Zbierka mikrofilmov

g/ Zbierka xerokópií a fotokópií - Zbierka mikrofilmov a zbierka xerokópií a fotokópií obsahuje kópie dokumentov uložených v Literárnom archíve, ako aj dokumentov, ktoré sa nenachádzajú vo fondoch a zbierkach LA.

B/ Prvostupňovo spracované fondy a zbierky:

Údaje uvádzané pri popise fondov a zbierok:
Názov fondu, zbierky - časový rozsah fondu, zbierky - počet dokumentov (jd.) - archívne pomôcky (S - súpis)
1. Osobné fondy

2. Fondy inštitúcií a spolkov

3. Zbierka jednotlivín, 14. – 21. storočie, 140 šk., S